제3차 세계 대전이 극적으로 끝남에 따라 양자 기술의 실험적 응용은 인류는 양자 변혁의 시대로 불리는 참신한 산업혁명에 진입하기 시작했다. 신냉전 시대도 시작됐다.여러 나라가 합병한 CES는 제1대국이 되었고, 그러나 과학 기술의 급속한 발전, 빈부 격차의 확대와 종교 문제로 인한 높은 범죄율을 감출 수 없다. 정부는 시민들의 몸에 칩을 묻어 범죄 행위를 감시한다.
체포된 용의자와 타국 간첩들은 일방적인 재판을 받게 될 것이다. 법원의 집행자가 사망을 가져갔다. 진압 역할을 원하는 정부는 처형 활동 전체를 생중계하고, 그러나 시간이 지남에 따라 국민들은 점점 그것을 오락 프로그램으로 보는 것 같다.
2054년, 프랭크 연방 공화국의 필리아 ·폰 크리스티안이 방문하는 동안 군 특수기관이 양성한 릴리아 ·세트 중사는 이자크 소속 독립부대 제3소대에 배치됐고, 필리아를 보호하는 임무를 수행한다. 그러나 임무 중 한 가지 사고로 인해 릴리아 ·세트는 자신의 존재에 대해 의문을 품기 시작했다....